- reconnaissance Natura 2000: exemple des massifs et plateaux de l’ouest
- ZNIEFF (Zone Naturelle d’Intérêt Faunistique et Floristique): exemple du Fenouillet, des massifs et plateaux de l’ouest
- les milieux aquatiques (rivières, zones humides, bras mort) et les forêts rivulaires ou ripisylves sont des habitats pour la faune et la flore:
- de nombreuses espèces piscicoles: barbeau méridional, blageaon, anguille, brochet, chevesne, etc.
- une richesse benthique : exemple de la grande perle dans les gorges du Gapeau
- exemple de l’écrevisse à patte blanche
- de nombreuses espèces d’oiseaux, chiroptères, etc.
Les milieux aquatiques sont dégradés et la présence de nombreux ouvrages entrave la continuité piscicole.
De nombreuses espèces invasives telles que la renouée du Japon, la Canne de provence, l’hélante, le robinier faux acacia, etc. contraignent le développement de la ripisylve.